《指南》力求彰显指导性、针对性、实效性，具有以下特点：（1）强调价值性和科学性的统一，既突出正确的价值导向，又体现合理的科学要求；（2）突出问题导向和针对性，针对科研评价的现实问题，从各个环节提出改进建议；（3）指导性与操作性相结合，既有抽象的原则要求，又有具体的参考办法；（4）体现依法改进、依法管理，追求科研评价的制度化和规范化。
《指南》由6章正文和3个附录组成。第1章“导言”，论述了科研评价的重要价值、现存问题和相关概念。第2章“评价的思想导向和基本原则”，概括了评价的思想导向、基本原则，及落实要点。第3章“评价标准和指标体系的确定”，提出了科研评价的一般标准、分类标准和评价指标。第4章“评价方法和程序设计”，论述了评价方法的基本类型和选择规则、应用要点和程序设计。第5章“评价制度和组织实施”，阐述了重点评价制度的建设、评价制度设计的要点与评价的组织实施。第6章“结语”，从理念、机制、方法和文化四个方面提出了改进高校评价工作的重点任务。附录部分则收录了教育部有关科研评价改革的文件，以及部分高校有代表性的评价方法。
《指南》适用于全国高校哲学社会科学研究人员、研究机构、研究项目、研究成果的评价工作，对高校的人事考评、职称评定、学科评审、学位认定等，也具有重要的参考价值。《指南》的出版发行，有助于提高科研评价活动的科学性、公正性、有效性，营造良好的学术环境，提升研究质量和创新能力，促进高校哲学社会科学的健康发展。
