招收和培养研究生的机构不仅只有大学，还有许多各有特色的研究所、院，比如中国科学院研究生院、中国社会科学院研究生院、中国人民银行研究生部等等。这些科研院所对于很多学生来说可能很陌生，甚至有些同学们平日都不清楚，但不了解并不意味着这些科研院所实力不强，相反，这些科研院所在其所在的领域往往处于研究前沿，科研实力不容小觑。
与一般的高校招生单位相比，选择科研院所有许多优势：
第一，与一般高校相比，科研院所的录取率高，录取程序也更公正。"名校"之所以为大家所认可，固然与其自身严谨的治学之风和科研实力分不开，但同学们的口耳相传也不失为一个重要因素，而这正是各个科研院所所欠缺的，因为科研院所只进行研究生的培养。没有自己的本科生，使得科研院所的"名气"不大，每年报考的学生相对比较少，录取率更高；没有自己的本科生，也使得科研院所在招生时，录取程序更为公正，不会出现一般高校招生中偏爱招收本校学生的情况。
第二，科研院所的培养侧重实践，实践经验更易提高。与一般高校的培养模式相比，科研院所在注重理论培养的同时，更加侧重实践操作。许多科研院所在进行研究生培养时，主要以承接项目的形式来进行培养，使学生能直接参与到项目中，锻炼学生的动手实践能力。
第三，研究生待遇高。由于科研院所培养学生的经费大多是来自于所承接的项目，所以学生在读研期间相对于"半工半读"，除了获得一些生活补贴之外，导师额外还会有许多补贴。有些科研院所，如电信科学技术研究院事实上就是大唐集团的前身，在这些科研院所读研，就相当于已经在企业中开始从事研发工作了，生活待遇和补贴自然也就比一般高校高了。
第四，有实力的独立院所一般都有相当数量的博士点和博士后流动站，如果有继续深造的打算，在研究所里一口气读完也不难，还可以留下继续做博士后研究。独立院所在实施硕博连读制度、提前攻博制度上相比高校也更加灵活，他们通常会鼓励部分优秀的硕士通过以上方式直接转为攻读博士学位。
第五，作为以科研为主的单位，许多独立院所并没有专门的教育经费，培养研究生的很多费用是由项目课题组和导师来承担的。因此，学生也主要通过参与各种科研项目在实践中进行学习。在研究院所里，科研项目一般来说是充足的，学生的实践机会以及从中挖掘选题发表论文，甚至与项目组共同发表论文的机会也就相应多一些。
第六，独立研究院所是行业中的科研单位，研究人员和行业圈子的联系和交流是广泛而密切的，在这里学习，就相当于一伸手就可以触摸到本行业的第一线，这对于积累行业人脉资源、增加实践经验和就业机会都是大有帮助的。
第七，研究院所与国外相关机构的学术交流和业务联系很紧密，许多导师也具有海外留学背景，这些条件可以为研究生提供许多参加国际会议和学术交流的机会，同时，还可以向学生提供或者帮助联系出国留学的就会。
第八，在留校问题上，在高校里，门槛已经相当高了，不过在一些独立院所，因为实力、牌子、生源、宣传以及单位本身的行业性质等各种原因，硕士生还是有可能留下来做科研的，甚至可以拿到千金难求的一线城市户口。
第九，独立研究院所是以科研工作为核心的单位，各种科研项目是它们的组成细胞，研究人员基本上以申请和开展科研项目、争取科研经费和发表科研成果为主要工作，凭借实力，他们拥有不少行业内的顶尖科研项目和重点项目。
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